电磁兼容实验室是在全国高校和铁路部门中成立最早的电磁兼容研究机构。2009年北京交通大学电磁兼容实验室按照国际标准ISO/IEC-17025建立了独立的管理运行体系，通过了专家评审，独立获得了实验室的国家认可（CNAS）和国家计量认证（CMA）资质。实验室主任为闻映红教授。

　　实验室主要研究方向：系统内电气电子设备间的电磁兼容性研究；系统间的电磁兼容性研究；电磁兼容测量技术研究；高速移动信道的电波传播特性研究；电磁环境及材料的电磁特性测量方法研究；天线与射频系统的研究。

　　实验室已完成了20多项国家、省部级电磁兼容研究项目，获得国家、全军、省部级科技进步奖14项，参与制定了10多个电磁兼容国家标准和2个铁路行业标准。